MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 39574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	AT	3	6	29462	29467	50 %	50 %	0 %	0 %	294494719
502	NC_014002	AAAT	2	8	29534	29541	75 %	25 %	0 %	0 %	294494719
503	NC_014002	GCA	2	6	29574	29579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494719
504	NC_014002	TAA	2	6	29590	29595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494719
505	NC_014002	A	6	6	29594	29599	100 %	0 %	0 %	0 %	294494719
506	NC_014002	ATT	2	6	29612	29617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494719
507	NC_014002	T	7	7	29616	29622	0 %	100 %	0 %	0 %	294494720
508	NC_014002	TTC	2	6	29783	29788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494720
509	NC_014002	GGAT	2	8	29800	29807	25 %	25 %	50 %	0 %	294494720
510	NC_014002	AGG	2	6	29837	29842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494720
511	NC_014002	T	6	6	29870	29875	0 %	100 %	0 %	0 %	294494720
512	NC_014002	GCA	2	6	29902	29907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494720
513	NC_014002	CCG	2	6	29919	29924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494720
514	NC_014002	CAG	2	6	30044	30049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494720
515	NC_014002	GTTG	2	8	30235	30242	0 %	50 %	50 %	0 %	294494720
516	NC_014002	TCC	2	6	30275	30280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494720
517	NC_014002	CT	3	6	30283	30288	0 %	50 %	0 %	50 %	294494720
518	NC_014002	TGG	2	6	30318	30323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494720
519	NC_014002	TAC	2	6	30341	30346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494720
520	NC_014002	AAT	2	6	30401	30406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494720
521	NC_014002	ATG	2	6	30449	30454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494720
522	NC_014002	T	6	6	30478	30483	0 %	100 %	0 %	0 %	294494720
523	NC_014002	CCA	2	6	30517	30522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494720
524	NC_014002	TGC	2	6	30540	30545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494720
525	NC_014002	GCA	2	6	30597	30602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494720
526	NC_014002	GCCT	2	8	30664	30671	0 %	25 %	25 %	50 %	294494721
527	NC_014002	CGC	2	6	30761	30766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494721
528	NC_014002	CAG	2	6	30773	30778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494721
529	NC_014002	CA	3	6	30821	30826	50 %	0 %	0 %	50 %	294494721
530	NC_014002	TAT	2	6	30924	30929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494721
531	NC_014002	TGGA	2	8	30958	30965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014002	AGA	2	6	31011	31016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014002	AATT	4	16	31051	31066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014002	A	6	6	31071	31076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014002	ATT	2	6	31082	31087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014002	TA	4	8	31134	31141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014002	TAT	2	6	31208	31213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014002	AATA	2	8	31253	31260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014002	TGT	2	6	31294	31299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494722
540	NC_014002	CTG	2	6	31305	31310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494722
541	NC_014002	GAA	2	6	31341	31346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494722
542	NC_014002	GAATAT	2	12	31509	31520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294494722
543	NC_014002	ATCA	2	8	31648	31655	50 %	25 %	0 %	25 %	294494722
544	NC_014002	TGAC	2	8	31729	31736	25 %	25 %	25 %	25 %	294494722
545	NC_014002	TGG	2	6	31763	31768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494722
546	NC_014002	AGA	2	6	31844	31849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494722
547	NC_014002	TGA	2	6	31931	31936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494722
548	NC_014002	TC	3	6	31977	31982	0 %	50 %	0 %	50 %	294494722
549	NC_014002	TGA	2	6	32021	32026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494722
550	NC_014002	GAT	2	6	32103	32108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494722
551	NC_014002	AAT	2	6	32147	32152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494722
552	NC_014002	A	6	6	32335	32340	100 %	0 %	0 %	0 %	294494722
553	NC_014002	TCC	2	6	32385	32390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494722
554	NC_014002	ATTGCC	2	12	32433	32444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294494722
555	NC_014002	CGG	2	6	32578	32583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494722
556	NC_014002	ATG	2	6	32584	32589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494722
557	NC_014002	AAAG	2	8	32780	32787	75 %	0 %	25 %	0 %	294494722
558	NC_014002	AAT	2	6	32790	32795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494722
559	NC_014002	GGC	2	6	32811	32816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014002	ATT	2	6	32853	32858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494723
561	NC_014002	ATG	2	6	32877	32882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494723
562	NC_014002	AGT	2	6	32908	32913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494723
563	NC_014002	CTG	2	6	32949	32954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494723
564	NC_014002	ACT	2	6	32990	32995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494723
565	NC_014002	AAAGT	2	10	33017	33026	60 %	20 %	20 %	0 %	294494723
566	NC_014002	TTG	2	6	33098	33103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494723
567	NC_014002	TGC	2	6	33133	33138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494723
568	NC_014002	GGA	2	6	33163	33168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494723
569	NC_014002	CATC	2	8	33183	33190	25 %	25 %	0 %	50 %	294494723
570	NC_014002	GTC	2	6	33271	33276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494723
571	NC_014002	GGA	2	6	33316	33321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294494723
572	NC_014002	ATTCC	2	10	33343	33352	20 %	40 %	0 %	40 %	294494723
573	NC_014002	ATG	2	6	33353	33358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494723
574	NC_014002	TAT	2	6	33370	33375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494723
575	NC_014002	ACC	2	6	33449	33454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294494723
576	NC_014002	AGT	2	6	33482	33487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494724
577	NC_014002	TCC	2	6	33542	33547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294494724
578	NC_014002	CTT	2	6	33553	33558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494724
579	NC_014002	GAAG	2	8	33569	33576	50 %	0 %	50 %	0 %	294494724
580	NC_014002	ATT	2	6	33579	33584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494724
581	NC_014002	AAGGG	2	10	33648	33657	40 %	0 %	60 %	0 %	294494724
582	NC_014002	ATG	2	6	33798	33803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494724
583	NC_014002	CCTG	2	8	33807	33814	0 %	25 %	25 %	50 %	294494724
584	NC_014002	C	6	6	33972	33977	0 %	0 %	0 %	100 %	294494724
585	NC_014002	GGC	2	6	34058	34063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
586	NC_014002	GGC	2	6	34157	34162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
587	NC_014002	GTT	2	6	34222	34227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494724
588	NC_014002	CAG	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494724
589	NC_014002	CGG	2	6	34312	34317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294494724
590	NC_014002	TCA	2	6	34369	34374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014002	ATA	2	6	34393	34398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014002	CCG	2	6	34482	34487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294494725
593	NC_014002	ATA	2	6	34496	34501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494725
594	NC_014002	TTC	2	6	34652	34657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294494725
595	NC_014002	CAT	2	6	34684	34689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494725
596	NC_014002	TGC	2	6	34691	34696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
597	NC_014002	CTG	2	6	34757	34762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
598	NC_014002	AGT	2	6	34813	34818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494725
599	NC_014002	TGC	2	6	34830	34835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
600	NC_014002	CAG	2	6	34868	34873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494725
601	NC_014002	AAT	2	6	34970	34975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494725
602	NC_014002	TGT	2	6	35023	35028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294494725
603	NC_014002	CTGC	2	8	35062	35069	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
604	NC_014002	CTG	2	6	35087	35092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294494725
605	NC_014002	CCTG	2	8	35095	35102	0 %	25 %	25 %	50 %	294494725
606	NC_014002	TGGAT	2	10	35157	35166	20 %	40 %	40 %	0 %	294494725
607	NC_014002	GCA	2	6	35254	35259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494725
608	NC_014002	T	6	6	35315	35320	0 %	100 %	0 %	0 %	294494725
609	NC_014002	CAT	2	6	35402	35407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294494725
610	NC_014002	TGG	2	6	35461	35466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294494725
611	NC_014002	GAA	2	6	35487	35492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294494725
612	NC_014002	T	6	6	35523	35528	0 %	100 %	0 %	0 %	294494725
613	NC_014002	TTGT	2	8	35556	35563	0 %	75 %	25 %	0 %	294494725
614	NC_014002	TGAG	2	8	35646	35653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014002	AT	3	6	35678	35683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014002	GAT	2	6	35735	35740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014002	TGA	2	6	35744	35749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
618	NC_014002	TAA	2	6	35769	35774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
619	NC_014002	AGCA	2	8	35777	35784	50 %	0 %	25 %	25 %	294494726
620	NC_014002	ATA	2	6	35803	35808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294494726
621	NC_014002	CCCT	2	8	35852	35859	0 %	25 %	0 %	75 %	294494726
622	NC_014002	ATAC	2	8	35873	35880	50 %	25 %	0 %	25 %	294494726
623	NC_014002	AC	3	6	35891	35896	50 %	0 %	0 %	50 %	294494726
624	NC_014002	CAG	2	6	35905	35910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294494726
625	NC_014002	CAA	3	9	35922	35930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294494726
626	NC_014002	TAT	3	9	35977	35985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294494726
627	NC_014002	AGT	2	6	35992	35997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294494726
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760	NC_014002	TGC	2	6	41261	41266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_014002	T	6	6	41353	41358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_014002	GTA	2	6	41359	41364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_014002	TAA	2	6	41385	41390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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